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盐湖钾肥是青海省最早建立现代企业制度的公司之一，法人治理结构基本确立，股权多元化步伐明显加快，生产经营和财务决策拥有完全独立性，独立董事制度也已经建立，并在实践中发挥着积极作用。公司通过制定监督、约束机制和完善的内控制度，正确处理了出资人与公司独立性的关系，实现了有效制衡，有效保证了企业的稳健运行。
盐湖钾肥发展到今天，已经具备了强有力的抵御市场风险的能力，也可以从容应对生产经营中出现的波折，但公司意识到投资失误将使企业背上沉重的包袱，因此在完善董事会管理职能的同时，公司在重大项目决策机制方面制定并坚持了五大原则，即：效益原则、市场原则、优势原则、技术原则和效率原则，将效益好不好、市场是否认同、风险大不大、综合优势是否明显、技术是否先进可靠、投资效率是否高效等等作为公司决策的原则。同时，公司提出了“思路决定出路、决策总揽全局、组织关系成败、机制保障实施”的管理理念以及“科学管理、持续贯标、质量取胜、用户满意”的质量方针，为公司的快速发展奠定了坚实基础。
公司首先加强财务管理，防止资产缩水。其次实行全员量化、综合指标考核，以指标为杠杆调节和保障各系统稳定运转。目前，公司已经全面建立起规范的、具有可操作性的考核机制和指标体系。细节决定成败，而加强细节管理首先要抓好现场管理。公司力争通过强化领导力、加强创新力、加大执行力，同时加强审查和自省，时刻审视管理由松散向严密、由粗放向精细、由无序到规范、由片面到全部的要求，不断提高现代化管理水平。
2004年为盐湖钾肥的管理创新年，公司以创办“学习型企业”为契机，开展全员创新活动，推行全员、全方位、全过程质量管理。通过量化、细化、标准化、制度化，把与生产有关的指标全部纳入考核，准确把握考核指标的程度。同年9月，公司通过了中国质量认证中心的外部审核，完成了ISO9001：2000版的换版工作。2005年的工作主题为“双增年”，即以20万吨和10万吨钾肥生产装置在双达标、双达产的基础上进一步实现双达标、双增产，全面提高企业的市场竞争力和可持续发展能力。
