北京双鹤高科天然药物有限责任公司北京地区植物药生产基地
北京双鹤药业经营有限责任公司华北区域核心商业公司、产品销售主渠道
郑州市双鹤药业有限责任公司中部地区营销中心
牡丹江温春双鹤药业有限责任公司东北地区输液基地
黑龙江双鹤医药有限责任公司东北地区营销中心
山西晋新双鹤药业有限责任公司西北地区注射液生产基地
西安京西双鹤药业有限公司西北地区大输液生产基地
西安双鹤医药股份有限公司西北地区重点医药商贸企业
昆山双鹤药业有限责任公司华东地区合成抗菌药物生产基地
安徽双鹤药业有限责任公司华东地区输液主要生产基地
合肥神鹿双鹤药业有限责任公司华东地区植物药生产基地
武汉滨湖双鹤药业有限责任公司中南地区输液生产基地
长沙双鹤医药有限责任公司中南地区双鹤产品销售渠道的战略基地
湖南双鹤医药有限责任公司中南地区医药商贸中心
云南双鹤医药有限公司西南地区重点医药商贸企业
资料来源：双鹤药业1999～2003年年报整理
遗憾的是，这些子公司除了在战略上继承了双鹤药业大商贸战略的思路而同样快速扩张、由此又造成更多的双鹤孙公司外，其他方面并无应有的策略和措施。
在对医药并购领域的华润系进行研究时，可以发现华润对于被收购企业均采取强势手段，例如更换管理层、淘汰旧有员工、灌输企业理念和文化等；而在对双鹤药业的收购进行研究时，发现其对被收购企业所采取的措施似乎更为“人性化”，例如较少更换管理层和旧有员工、不会采取措施灌输双鹤理念和文化等。这样的做法，更像是一种投资管理型的风格，然而双鹤药业却缺乏投资管理型所应有的严格的财务控制和法律保障，否则也就不会在投资管理决策和程序上出现诸多弊端。
