创立初期，新东方在线比较好地完成了法人治理结构，集团作为在线的股东，它行使的是作为股东的权利和义务，集团是通过董事会来对在线进行管理。无论从战略还是每年工作目标来讲，都是董事会讨论决定的。但是，公司日常运营是由公司的管理团队来独立完成的。新东方在线成立5年，俞敏洪去开会的次数不超过10次。“你要放一个人上去就要放心，如果放一个不放心的人上去还不如不放。”俞敏洪说。对于接任钱永强位置的孙畅，俞敏洪也很重视。因为互联网行业与教育行业不同，孙畅有着丰富的互联网工作管理经验，加上学过教育专业，又在做钱永强的副手。俞敏洪在亲自和孙畅共同工作10天后，让孙畅成为了新东方在线CEO的接班人。
如何支持新公司？
当时，集团对新东方在线的政策倾斜已经快到了极致，甚至有着“宁可牺牲面授课堂，也要保证在线的客户”的说法。集团要求所有学校刊登的课程广告、学习手册上都必须带上在线的宣传。当然，俞敏洪这样的“全力支持”也源于集团的“私心”：学校做得再好也不能上市，但是互联网可以。
因此，新东方在线的“插足”不但没有动用自己的成本，而且还有可能与面授课程抢生源，由此将引发的矛盾是可以想像的。
“一些部门的不满是预料之内的事情。但是我们使用行政命令去全力支持新产业的发展。在新东方，这个方法还是有效的。”俞敏洪这样说道。不过，行政命令只能短时间内“逼迫”学校接受集团这样的安排，但毕竟不是长久之计。
“在线很快对网上的课程进行了调整，而不仅仅是面授课堂的电子版。现在你到网络上学习，能感受到的是与线下完全不一样的感受。同时，我们也要求在线积极扩展内容领域，除了英语，会计、律师等很多方面的内容也出现了。这样会缓解内部矛盾，同时促进在线的有机生长，使它们平衡。”俞敏洪说。
他认为后来的联想撤资事件给众多“新东方们”的启示是：当子公司需要母公司大量资源支持的时候，母公司最好不要跟其他不相关的机构合作，这样容易形成拉扯的力量而非聚合的力量。“当时让联想撤资其实也是我们的想法，”俞敏洪说，“当时集团给了在线很多政策倾斜，本身已经使一些部门不满，而同时赚来的钱又有50%需要给外人。这让一些部门更不满意了。长期这样下去不好。”
