第二个阶段，科学管理阶段，特征是科学的规范化、制度化、模式化的管理。其主要表现为，计划、组织、领导、控制等各个方面都有成套科学、规范的制度和程序，企业像一部高效运转的机器。在这种管理方式下，部门职能、岗位职责、行为准则、运作程序都实现了规范化；信息传递、各项工作实现了程序化；人才、资金、物资、时间等资源的利用实现了科学化。这个阶段是企业发展过程中最为重要的阶段，它为企业长远的发展打造了一个坚实的基础管理平台，（为其它专业管理、扩大经营规模、谋求多元化发展等企业经营活动奠定了稳固的基础和有力的支撑，）犹如企业大厦的地基，企业大厦能盖多高，取决于这个地基能打多深多牢。
“以制度为行动指南”的远大（中央空调）在这方面就做得非常好，近50万字的制度文件几乎覆盖了每一个员工的每一项活动，大到工作流程，小到衣食住行，应有尽有。（很多企业也制定了不少的制度文件，但不能贯彻执行或不能长期坚持，其原因就是没有做好这一步基础工作而缺乏操作性所致。）正如其总裁张跃所总结的一样，正是由于这种强大的制度化管理，才造就了远大多年的辉煌，这种管理模式应该是它得以持续稳定发展的关键之一。
在这个阶段，企业从规律中提炼出规则，再形成规范，企业中90%以上的活动都细分到每一个员工的每一项具体工作上，而每一个细节动作都是程序化、标准化、规范化的。（做到这一步，企业的这些90%以上的活动就不必靠能人了，企业从此走出了能人的困惑。）但应该指出的是，即便这样，企业里仍然有许多制度和程序管不到、管不了的地方，这是因为管理常常滞后于企业发展的特质所决定的。另外一方面，太多的规章制度也让人掌握不了，同时对人的创造性、积极性还有一定的压制，既增大了管理成本又降低了运行效率。这时，每个管理者都会想，如果大家能自觉自愿地干，那该多好！我们还应看到，随着科学、规范的管理制度建立，创业时的激情和热情会渐渐消失怠尽，维系员工的除了合理而公平的激励机制外，更主要的是企业文化的牵引和凝聚。这就对企业的管理提出了新的要求，开始第二次主动的管理变革，完成企业文化的提炼和完善，进入第三个阶段——文化时代。
