为了使得会计师能够作出正直与客观的判断，一些执业规则和惯例能够确保其独立性，比如，会计师在与公司有利益关系的时候应该回避；其次，注册会计师在为客户提供审计服务时，不能同时为客户提供内部控制设计、代理记账、代理纳税或其他影响独立性的服务。安然事件后，管理咨询收入超过会计师事务所业务收入的50%以上，应考虑审计与咨询机构分立等等。
在会计师事务所对公司财务报告进行审计的过程中，如果公司故意提供虚假的信息，可能会对审计工作造成阻碍。
“垃圾进来垃圾出去，审计机构如果无法取得真实与公平的信息，它们最好的方法就是请求辞职。”张汉云说，“但德勤的请辞，也给了股东一个信号：一连两个会计师事务所的请辞，说明公司在某些方面存在问题。”
2000年，安达信对科龙电器的年报出具了保留意见。2001年，安达信拒绝对科龙电器的年报表示意见，这是其在国内首次拒绝对上市公司年报表示意见。2002年，科龙电器的会计师事务所更换为德勤，德勤又对科龙年报出具了保留意见。
“会计事务所受限无法开展审计，可以根据不同的情况出具保留意见、否定意见、无法表示意见或根据事先的约定书拒绝审计来免于承担责任。”费国平说。
“倒顾三人组”中的注册会计师朱德峰告诉本报，目前中国上市公司的公司治理结构情况决定了会计师事务所无法独立，违反了注册会计师行业设立的初衷。随着公司经营权和管理权分离，会计师事务所作为第三方机构出现，本该是独立的，但会计师事务所要审计的对象成了聘用者，这种情况下，很难保证会计师事务所在面对上市公司经营管理层的时候还能保证独立性。“如果提供虚假证明文件，会计师事务所将会承担相应的法律的责任。”费国平说，依据《证券法》的相关规定，为证券的发行、上市或者证券交易活动出具审计报告、资产评估报告或者法律意见书等文件的专业机构，就其所应负责的内容弄虚作假的，没收违法所得，并处以违法所得一倍以上五倍以下的罚款；并由有关主管部门责令该机构停业，吊销直接责任人员的资格证书。造成损失的，承担连带赔偿责任。构成犯罪的，依法追究刑事责任。同时，欺诈如果得以认定，将有可能承担损害赔偿责任。
