除了自身的创新之外，让董文标感觉“最为痛苦的”是银行业目前的外部生态环境。“本来银行是一个企业，但是生态环境使你不能按企业去运作这是最痛苦的事情。”
2006年1月7日，在第八届北大光华新年论坛上，被张维迎称为“见过的最幽默的行长”的董文标就大倒苦水。他说，国有商业银行有三座大山，定价制度、分业管理、高赋税制；相对僵化的定价制度使得银行改革落后于其他行业，而单一的存贷款业务，把银行卖得越来越愚蠢，把企业整得死去活来，高赋税制则又使银行的激励能力非常之差。
作为五位行长中最后一位发言的董文标说，除此三座大山之外，股份制银行还多了一座——歧视政策。“比如张老师让国有银行（行长）先讲，就是歧视。我们商业银行在这方面地位是非常差的。很多的政府红头文件，这个不能给股份制商业银行，那个不能给股份制商业银行，比方住房公积金，只能给国行，不能给我们，这是什么道理？信息也是一种资源，像郭行长（建行董事长郭树清）参加经济工作会议，就知道信息，信息就是资源。这就是歧视政策。别人是三座大山，但我们多一座，所以说银行业改革没有良好的金融生态环境，没法搞的。”
自认为“性别”和别的银行不一样的董文标，对于自身的改革，自信而又谨慎地说：“民生银行需要三年时间，调整提升完成以后，应该说是一个好的银行。”
