与此同时，伊利强化了科研人员队伍的建设，采取高酬薪、设立奖励机制等措施吸引和留住人才，激励人才创造最大价值。目前，伊利共拥有研发技术人员405人，其中拥有高级技术职称和博士学位的专家60人，中级技术职称122人，还长期聘用海外专家11人，专职研发人员占职工总人数比重的5.5%，已经建立了一支知识全面、水平先进的技术研发队伍。2004年，伊利先后派出技术骨干和负责人10批、近60人次赴德国、法国、新西兰、日本、韩国、丹麦、澳大利亚等国家参加国际学术会议、访问国外著名乳品研究单位和考察学习世界先进的技术和质量管理技术。
先进的研发设备和高素质的科研队伍产生了强大的研发实力。2004年，伊利共获得专利权105项，并被国家知识产权局列为\"全国企事业专利工作试点单位\"。伊利是国内首家也是唯一一家获此殊荣的乳制品企业。截至2004年，伊利共获得各种专利近500项。据统计，2004年，伊利共完成包括技术改造和基础技术研究在内的项目73项，其中公司共自主研发完成公司自立项目70项，自主完成国家资助的星火项目2项，与高校合作完成基础技术科研课题1项。此外，伊利2004年还与其他研院校合作一起承担了由国家资助的\"十五\"奶业重大科研课题1项。
在众多研究成果的基础上，伊利在新产品研发上也继续保持了良好的增长势头，增加了功能、休闲、方便的固体奶食品的研发，全年共开发新产品67个，新产品的销售收入达到21亿元，占全年总销售收入的比重超过24%。近年来，伊利每年都开发几十个新产品，尤其是在奶粉领域取得了重大突破。
在奶粉领域，消费者以前普遍认为洋品牌比国产品牌好。实际上，伊利的研发人员通过研究发现，在蛋白质、脂肪酸、氨基酸、花生四烯酸、核苷酸、β-萝卜素、维生素以及微量元素等一系列营养成分上，伊利的奶粉和洋品牌几乎没有区别。更重要的是，在婴儿奶粉的营养成分方面，伊利的科研人员通过研究发现，洋品牌的奶粉并不见得适合中国消费者。因为日常的饮食习惯不一样导致中西方母乳的成分不一样，洋品牌奶粉尤其是婴幼儿奶粉基本都以西方人的母乳为参照研制而成，因此，中国宝宝并不适合喝洋品牌奶粉。
