海航的第一次直接融资是从海航的股份制改造开始的。1993年海航以重新评估的1334.0552万元国家股与中国光大国际信托投资公司、交通银行海南分行、中国国际旅行社总社、海南航空进出口贸易公司等17家法人单位为发起人，组建了海南航空股份有限公司。注册资本为25010万元，总股本为25010万股。形成的股权结构，国有股1334.0552万股，占5.33%，法人股18675.9448万股，占74.67%，并在STAQ系统上市。内部职工股5000万股，占20%。企业总资产为12.4亿元，资本的长期负债率66.3%。1994年海航的分红方案确立为每10股送2股，共送红股5002万股，总股本增至30012万股。
第二次直接融资是1995年向美国航空有限公司出让1亿外资股股份，每股价格为0.2449美元，共获得2500万美元股权转让金，折合人民币2.079亿元，占当时总股本的25%。第二次直接融资不仅在一定程度上解决了海航对外汇的需求，而且使海航进入了国际资本市场，提高了海航在国际资本市场和资金市场的知名度和信用度，同时为海航学习西方先进的管理经验与技术提供了便捷的渠道和方式。引入外资股后，美国航空有限公司在董事会9个席位中只占有2个席位，海航的总股本增至为4亿股。其中，国家股占4%，法人股占56.01%，个人股占14.99%，外资股占25%。从总体上看，海航的中方股东仍占大多数。
第三次直接融资是海航发行A股和B股，转为公众公司。1997年海航在境内发行外资股B股7100万股，发行价格为每股0.47美元，公司取得募集资金3337万美元，折合人民币27669万元，其中7100万元转做股本，其余扣除发行费用后转为资本公积金。发行B股后，公司的注册资本为4.71亿元。进一步解决了公司的外汇需求，平衡了公司的股本结构。1999年，公司A股在上海证券交易所挂牌上市，上市总股份为20500万股，发行价格为每股4.6元人民币，募集资金近9.43亿元，扣除发行费用外，20500万元转做股本，其余转为资本公积金。A股发行后，股份公司的注册资本为6.76亿元。股东权益增到20.26亿元，公司总资产达到66.02亿元。到1999年为止，海南航空股份有限公司的股本为67616万股，其中国家股占2.37%，境内法人持有股份占33.14%，内部职工股占8.87%，境内上市外资股占10.5%，外资法人持有股份占14.80%，社会公众股东占30.32%。
