汽车在线没有任何复杂的组织结构，除了必要的人力资源和财务部门外，仅设立了一个运营中心，运营经理由吴端平兼任。所有的部门经理都是该运营中心的成员，一有问题运营中心立即协商并各自向下面传达。这样做极大地简化了决策的流程。
吴端平现在感到头疼的是如何在严格控制人员规模的条件下，提高整个公司的效益并把公司纳入快速发展的轨道。企业要发展，就必须不停地拓展新业务，这无疑需要更多的人加入新业务的开发和运营。然而，要想控制住成本，让互联网不烧钱，就必须牢牢控制在新技术企业成本构成中占据较大比重的人力成本，人员的规模必须得到控制。
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