每一个贝冢都盛满了贝冢形成年代的植物和花粉的标本，尤如一个揭示历史的时间仓库。科学家们研究了大量的佩特拉贝冢，发现在早期的纳巴泰人时代，橡树林遍布佩特拉四周的山地；然而到了罗马时代，大量的森林消失了。人们为了建房和获取燃料砍伐了大量的木材，致使林区衰变成为灌木林草坡带；到了公元900年，这种衰退进一步恶化，过分地放牧羊群使灌木林和草地也消失了，这个地区逐渐沦为沙漠。
科学家们认为环境恶化是导致佩特拉衰亡的因素之一：当周围的环境再也无法为庞大的人口提供足够的食物和燃料时，城市就彻底消亡了。佩特拉如同一本仅被读过几页的书，在发现拜占庭教堂之后不久，人们又留意到了一根拔地而起的花岗岩石柱。约旦国境内没有花岗石，肯定来自埃及。看着那根花岗石柱，人们常常在想，地下面究竟埋藏着什么。一座皇宫？一座教堂，无论走到佩特拉城的何处，都会面对这样一些谜。
