由于资本运营的理论研究和实践探索时间较短，尚不成熟，人们长期形成的传统观念、经营思维和企业运作方式与规范化的资本运营还存在较大的差距，加上资本运营所需的制度环境和条件尚不充分，资本运营在我国企业的实践中存在着诸多误区。
误区之一
把资本运营理解为股票投资或金融商品买卖等资本直接运作行为
在现实中，许多企业片面地把资本运营视同于股票投资或者金融商品的买卖。比如，一些企业特别是上市公司打着资本运营的旗号，把通过直接融资筹集来的资金或者高息拆借给商业银行、证券公司、投资公司等金融机构;或者直接投入证券市场，从事股票、债券的买卖。企业投资于证券市场，通过证券投资这一资本的直接运作方式来实现企业资本的保值增值和对利润最大化的追求，本来无可厚非，不应指责。但是，如果一个企业放弃主营业务于不顾，特别是在主营业务比较差的情况下，把投资转化为投机，试图以此来弥补主营业务的不足。这不但有悖于资本运营的初衷和本质，而且有可能使企业进一步陷入困境。对于那些不注重改善经营管理，抱着在股票市场上投机“捞一把”思想的企业，一旦股票投机失败，其后果不堪设想。事实证明，能够通过股票投机获利者毕竟只有少数。
误区之二
割裂资本运营与生产经营的内在联系，把资本运营作为游离于生产经营的更为高级的经营形式
在当前的资本运营过程中，有一种观点和倾向，认为资本运营是独立于生产经营而存在，目的在于提高资本营运效率和效益的经济行为和经济活动，是比生产经营更为高级的经营方式。我们认为，这种观点不仅在认识上是错误的，而且在实践中是有害的，它极有可能误导国企改革，把当前的资本运营引入歧途。一般来讲，在市场经济条件下，资本运营在时空上可以暂时脱离生产经营而单独运作并获取一定的资本收益，但这仅是从表层而言的，实质上，资本运营最终必须服从或服务于生产经营。生产经营是资本运营的前提和基础，离开了生产经营，资本运营势必成为无源之水、无本之木。
