日本烟草的发展战略目标是成为全球化、多元化经营、长期稳定增长的跨国公司。为实现这一目标，近年来日本烟草在跨国收购，烟草、生物制药、食品产品研发，公司产权民营化，决策系统改革，生产体系调整等方面采取了一系列战略措施。
在日本烟草推动下，日本国会于2002年4月通过了《日本烟草公司法》修正案，修正案降低了日本对日本烟草的持股要求，由原来规定至少持有2/3的股份变为至少持有1/2的原始股;同时，允许日本烟草发行新股票，但总量不得超过100万股。在新修正案的规定下，日本烟草获得了改变，减少控制，增强经营自主权的更大操作空间。
2002年4月，日本烟草制定了中期经营发展计划，在烟草、生物制药、食品等业务方面提出具体经营发展目标与措施。在国内市场，其目标是稳定市场份额，提高卷烟附加值，保持其在公司中的支撑作用;在国际市场，其目标是通过促销、提高价值、降低成本，加速业务收入增长;在生物制药方面，其目标是增强公司研发能力，加快新产品的临床试验和成功产品的产业化发展，使生物制药成为日本烟草未来发展的支柱产业;在食品方面，其目标是开发高附加值产品，建立新的模式，保持稳定增长。
日本烟草十分注重提升“JT”的价值。日本烟草认为要实现长期增长，公司必须有独一无二的优越之处，而且这些优越之处应能被整个集团分享。根据其多领域经营、多产品的企业特点，2004年4月，日本烟草提出了“日本烟草宣言”。把“JT”作为公司一个统一的、整体的形象推向市场，使“JT”统领其具体的产品，形成公司的整体战略。
