此时，经过一路激战和行军追赶，加上恶劣的沼泽环境，拿破仑45万大军损失惨重，仅剩16万兵力，由于战线深入，后勤供应也成了问题。在斯摩棱斯克一战虽然胜利，但是对方已经将城焚烧，并没有获得新的补给。拿破仑将赌注压在了最重要的城市莫斯科。
俄军节节败退，沙皇亚历山大一世相当不满，新授命当时俄国最有军事才能的元帅库图 佐夫为全俄联军总司令。此人足智多谋，为了阻挡拿破仑大军前进，迅速在博罗季诺修筑了坚固的防御工事。
果然，拿破仑率军如期而至博罗季诺城前，双方共投入兵力26万、大炮1200门，在几千米长的战线上开展了殊死较量，激战冲清晨一直持续到下午，双方士兵伤亡达到10余万人。夜晚时分，俄军撤退，拿破仑终于胜利。
此时的对手库图佐夫，正在面临一个艰难的抉择。经过白天激战，损失士兵约4万人。为保存俄军有生力量，他毅然决定，放弃莫斯科城！9月15日清晨，拿破仑大军终于进驻莫斯科城，但是让拿破仑失望的是，莫斯科城一片沉寂，早已撤空。
但无论如何，此刻躺在床上的拿破仑已经非常欣慰了，他认为俄国都城已经攻陷，沙皇投降是早晚的事，疲惫的部队终于可以休息才是当前的重点，这场战争胜的太不容易了，已经远远超出自己的预估。
突然，一整骚乱将拿破仑从思绪中拉回现实，副官声色慌张地闯了进来，大事不好，城中起火了。拿破仑向外望去，只见莫斯科城陷入一片火海中，风助火势，火焰冲天。其中一排房子的火势甚至蔓延到克里姆林宫的一角，拿破仑心中一团迷惑，但是面对大火已经不由得他多想，匆匆收拾一下行李便逃离了克里姆林宫。
拿破仑布置下属组织救火，但事到临头才发觉所有的灭火工具已被毁坏，士兵们一团混乱。大火慢慢吞噬着法军的粮草、武器，直到三天之后一场暴雨来到，灰烬里到处都是惨不忍睹的尸体。
