第二个环节是，认真抓好整改，确实取得实效，大致用2周左右时间。先进性教育活动开展以来，整改问题始终是一项重点要求，但是每个阶段的要求有所不同。第一阶段是边学边改，第二阶段是边议边改，第三阶段是集中整改。
在整改环节要做好三个结合：一是组织整改与个人整改相结合。既要重视整改各部门和各支部存在的突出问题，又要重视整改党员领导干部和普通党员个人自身存在的突出问题。每个党员要按照经过审核的整改措施，扎扎实实地进行整改。党组织要教育引导党员把解决突出问题、落实保持共产党员先进性的要求与履行岗位职责结合起来。在各自岗位上发挥先锋模范作用。党支部对党员落实整改措施的情况，要采取一定的形式进行跟踪检查，督促落实整改。对整改不力的要帮助其限期改进。要通过整改，进一步提高党组织的凝聚力、战斗力，进一步提高各部门破解难题的能力，进一步促进政府职能转变和工作作风转变。二是主题实践活动与联动整改相结合。继续抓好“双结对”等主题实践活动，同时对于一些基层和群众反映强烈的、涉及多个部门的问题，要发挥各部门协同作战的优势，努力为基层和群众解决实际问题。特别是对情况复杂、涉及面大，单靠经委一个单位难以解决的问题，要与有关部门加强协调，积极采取措施努力解决。三是近期整改目标与远期整改目标相结合。整改方案的制定要充分考虑问题的轻重缓急和难易程度，既有近期目标，又有中长期安排；既要考虑解决问题的必要性，又要考虑解决问题的可行性，不要不切实际的目标和口号。各党支部要将整改任务进行分解，明确责任和完成时间，落实具体责任人，并对整改情况认真进行督查。对具备整改条件的问题，要马上整改；对通过努力能够解决的问题，要限期整改；对那些应该解决但由于受客观条件限制一时解决不了的问题，要向群众说明情况，积极采取措施逐步解决。
第三个环节是，公布整改情况，开好群众通报会，大致用1周左右时间。要坚持开门整改，做到制定整改方案听取群众意见，整改过程吸收群众参与，整改结果及时向群众通报。集中整改阶段工作基本结束后，要在一定范围内公布领导班子和各党支部的整改情况，听取群众意见，接受群众监督。党支部要在适当时候组织党员过一次专题组织生活，交流党员个人整改情况，肯定成绩，找出差距，进一步搞好整改。