对于一个企业来说，BPR是一个重大而复杂的系统工程，在项目实施过程中涉及到多方面的活动和工作。参与企业信息化的成员在整个BPR过程中，不但应当知道如何进行BPR，由谁来进行BPR，而且还需要了解一些进行BPR的方法和工具。参加BPR的成员们如果能够有效地利用现代的BPR工具，就可以更有效地对企业中的问题流程进行改造，将BPR的各个阶段的工作有机地协调起来。
许多BPR项目失败的事实告诉我们：在实施BPR项目之前需要仔细考虑流程远景(BusinessVision)和实施计划。计算机模拟(仿真)已被接受作为一个强有力的仿真工具来支持BPR项目，因而这几年出现了许多专门用于支持BPR的模拟系统或决策支持系统。这些工具不仅可以用来分析已存在的流程模型，还可以用来评估即将实施的模型的潜在价值和可行性。比如，PeerV.olkner等提出了面向对象的基于模拟的方法来支持企业业务流程的设计;GeorgeM.Giaglis等提出了基于BPR和变化管理理论，将模拟用于组织设计中。尽管如此，现有的许多工具是仅仅用来分析和重新设计工作流(workflow)，而很少关注组织中的人及其角色。因此，韩国学者提出了基于角色的模拟和建模方法。
对企业现有业务流程的分析并提出改造的方案可以用计算机软件的方法来进行，这就是企业信息流程建模。目前已经有许多企业信息流程建模方法和相应的软件系统问世。ARIS(集成化信息系统架构)方法和工具是由德国萨尔大学企业管理研究所所长及IDS-Scheer公司总裁WilhelmScheer教授所提出。其设计理念是希望提出一个整合性的框架，将描述一个企业流程的重要观念尽量纳入到模型之中。IDEF0方法是ICAMDEFinitionMethod的简称，是美国空军在上个世纪70年代末80年代初在ICAM(IntegratedComputerAidedManufacturing)基础上采用SADT等方法发展起来的一套建模和分析方法。1990初期，IDEF用户协会与美国国家标准与技术学会合作，建立了IDEF0标准，并在1993年公布为美国信息处理标准。目前IDEF是多种国际组织所承认的标准。为了减少项目的复杂性，使项目得以顺利进展，项目实施小组可以运用基于计算机软件的建模分析工具，如BPWIN等来建模。使用这些方法对企业业务流程建模后，不但描述企业现行流程，进行流程诊断和设计新流程，还可以对企业业务流程进行有关成本、效益等方面的模拟和分析。
另外，美国专利局网上数据库表明许多DSS的工具已经被开发用于支持当今的管理实践中的流程设计，例如：支持敏捷制造管理的DSS系统。该系统整合了供应链管理与业务流程分析的思想，帮助企业在供应、需求、分销、库存方面优化流程，提升绩效。
