2、由施药技术引起。不正确的施药技术，不仅会浪费药物，降低药效，而且还易引起抗药性的发生，例如施药不均，一般在水表层和水体边缘部分施药多，含药浓度高，病原体的受药机会则较少。加之有些药物如呋喃唑酮、大蒜素等溶解度甚低，就是漂白粉也微溶于水因而极易产生不均匀的分布，这就为抗药性种群提供了生存的条件，尤其是病原体的卵、孢子阶段为甚。再则是施药的剂量，由于担心鱼类的安全(如用硫酸铜、醋酸亚汞、硝酸亚汞等)或缺乏施药经验，往往使用低于规定的剂量，特别是使用抗生素，如氯霉素、土霉素，红霉素等，使用量过低尤易诱发抗药性菌株的突变，这样既达不到防治目的，又易诱发病原体的抗药性，此外，在选用药物剂型、用药方式及病虫、病菌生物学等诸方面，均会产生抗药性有关。
3、饲养制度的影响。鱼类某些饲养制度，如辅放、套养补放等措施，很易使病毒、病菌、病虫等寄生条件改变，及扩大抗药种群的散布，据调查表明，许多成鱼塘内病原体大多由鱼种塘(包括本地或外地转运鱼种)转移过来，尤其在轮放套养鱼种或应用共同使用鱼网时比较明显。此外，在投喂水草及注排水等方面，也易带入有害生物的抗药性品种。
二、抗药性的预防对策
1、开展综合防治。首先要彻底清塘，合理地搭配混养，以改变病原体的寄生宿主；加强饲养管理，放养鱼种(包括轮放补种)、投饵及水质等均须严格消毒掌握准确的施药量和施药技术；以及定时检查病原体与抗药性的监测，以便在现有药物对某些病原体尚未失效之前，制定出轮换或更换药物等对策措施。
2、轮换用药。不要长期使用单一品种的药物，这样可切断病原体抗药种群的形成。轮换品种应尽可能选用机制不同的药物，如对中华鳋、水蜈蚣等可用灭虫精、灭虫灵，或敌百虫，由车轮虫引起的白头白嘴病可用灭虫灵、代森胺，敌敌畏或氯化钠，由指环虫、三代虫等引起的烂鳃并发痛可用肠特灵等药物，效果均较好。
