0引言
肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,近50年来,世界各国肺癌的发病率和死亡率总体呈上升趋势。研究表明p53基因突变与肺癌密切相关,因此,p53基因的早期、准确、定量检测很重要[1-2],但由于早期肺癌细胞的特征DNA含量和浓度较低,准确检测难,要解决这个难题,最有效的方法之一是对肺癌特征的p53基因片段进行质量检测。近年来,石英晶体微天平(QCM)因其准确度和精度高(可达纳克级),在生化分析、疾病诊断领域备受青睐[3-4]。
QCM生物检测的研究重点是选择合适的核心修饰材料以实现探针最大量的有效固定,因此,具有导电性好,催化活性高,比表面积大,吸附能力强,生物相容性好等特征的碳纳米管[5]是一个很好的选择。目前,已有少量利用碳纳米管制备压电生物传感器的报道[6-7],多集中在免疫类,但未见用于制备肺癌压电DNA传感器。
本文利用羧基化碳纳米管交联电极表面半胱胺自组装膜和DNA探针,提高对肺癌特征DNA探针的有效固定量,研制一种新型的肺癌压电DNA传感器,实现对肺癌特征p53基因片段灵敏、准确的质量检测,为肺癌的早期诊断提供一个新的、快捷的途径。
1 实验部分
1.1 仪器与试剂
QCM压 电 检 测 器、压 电 石 英 晶 体 (AT-切,10MHz,镀金,晶片直径为Ø8 mm,电极直径为Ø6mm)、数据采集卡、氮气干燥室(自制)、肺癌特征DNA探针(p53寡核苷酸探针):5′-XAGT ACGGCA TTG ATC ACT GG-3′(X=NH2)及肺癌特征DNA(探针对应p53基因片段)、801-D人巨细胞性肺癌细胞、多壁碳纳米管(MWCNTs)、半胱胺、1-乙基-3-(3-甲基氨丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)、N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)、Piranha溶液(98%H2SO4∶30%H2O2=3∶1(体积分数)),其他药品均为分析纯,实验用水均为重蒸水。
1.2 实验方法
实验操作主要包括DNA探针固定、标品检测,如图1所示。
1.2.1石英金电极的预处理
石英金电极于Piranha溶液中浸泡清洗3min,丙酮浸泡清洗3min,去离子水浸泡清洗3min,重复2次,然后将电极于氮气干燥室干燥备用。
1.2.2羧 基 化 的 多 壁 碳 纳 米 管 (MWCNTs-COOH)的制备及活化
参照文献[8]制备MWCNTs-COOH,在氮气室干燥 后 备 用,用 前 置 于5.0 mmol/L EDC和8.0mmol/L NHS混合溶液中活化1h。
1.2.3传感器体系的建立
操作主要分3步:
1)将预处理的石英金电极于1mmol/L半胱胺溶液中浸泡16h,取出后用磷酸缓冲液(pH=7.4)清洗,再于氮气室干燥。
2)滴加20μL活化的MWCNTs-COOH于金电极表面上,放置30min,然后用磷酸缓冲液(pH=7.4)清洗,再于氮气室干燥。
3)滴加20μL DNA探针溶液,置于饱和水蒸气环境下反应1h,然后用0.5 mol/L NaOH和0.25%SDS溶液依次清洗电极,再用少量磷酸缓冲液(pH=7.4)清洗,后放置氮气室干燥。
1.2.4检测方法
均匀滴加15μL、5μg/mL肺癌特征DNA或样品于金电极表面,然后用压电测定,记录频率变化值,直至频率变化值(ΔF<1Hz/min)稳定。
2 结果与分析
2.1单因素实验
2.1.1 MWCNTs-COOH浓度的影响
在磷酸缓冲溶液(pH=7.4)、25μg/mL DNA探针条件下,确定MWCNTs-COOH浓度对肺癌特征DNA检 测 的 影 响,实 验 选 用 浓 度 (c)分 别 为1mg/mL、3mg/mL、5mg/mL、7mg/mL及9mg/mL,记录检测肺癌特征DNA的频率下降值(ΔF)。实验发现,MWCNTs-COOH浓度为5mg/mL时的频降峰值为160 Hz;MWCNTs-COOH浓度低于5mg/mL时,频率下降值与浓度值正相关;MWC-NTs-COOH浓度大于5mg/mL时则负相关。由此可知,当MWCNTs-COOH在低浓度范围内,增加其浓度可增加DNA探针的固定量,当浓度达到某一临界值时,DNA探针固定饱和,如继续增加浓度,过多的碳纳米管会产生高位阻,从而降低探针的有效固定。
2.1.2 DNA探针浓度的影响
在磷酸缓冲溶液(pH =7.4)、5mg/mL MWC-NTs-COOH条件下,选用浓度为10μg/mL、20μg/mL、30μg/mL、40μg/mL和50μg/mL的DNA探针进行实验,记录检测肺癌特征DNA的频率下降值。实验发现,DNA探针浓度为30μg/mL时,频率下降达最大值(峰值为166Hz),这表明此浓度下DNA探针有效固定至饱和。
2.1.3溶液pH值的影响
在5 mg/mL MWCNTs-COOH、30μg/mLDNA探针条件下,确定溶液pH值对样品检测的影响,选用pH值为6.6、7.0、7.4、7.8、8.2的磷酸缓冲溶液进行实验,记录检测肺癌特征DNA的频率下降值。实验可知,磷酸缓冲溶液的pH=7.4时,频率下降达最大值(峰值为166Hz)。
2.2 实验条件的正交优化
2.2.1正交实验实验
基于上述单因素的分析结果,拟定正交设计方案进 行 实 验,力 求 找 出MWCNTs-COOH浓 度、DNA探针浓度、pH值的最佳配比,从而提高对肺癌特征DNA检测的灵敏度。正交实验设计如表1所示。表中,k1,k2,k3分别表示水平号为1,2,3时所对应的实验结果的平均数;R为极差。方差分析结 果 如 表2所 示。F表 示 方 差 分 析 检 验 值,F(0.05)临界 值 为 从F分 布 表 中 查 得F(0.05 )(2,2)的值;显著性为SPSS软件计算所得的sig.值,是显著性指标,sig.<0.05为显著,否则为不显著。
结合表1、2可知,实验条件对DNA检测影响程度为MWCNTs-COOH浓度>DNA探针浓度>溶液pH值,最佳的组合为A1C3D2,即MWCNTs-COOH浓度为4mg/mL,DNA探针浓度为35μg/mL,缓冲液pH=7.4。
2.2.2实验优化条件验证
本文对上述优化条件进行验证,重复3次,记录检测肺癌特征DNA的频率下降值。结果显示频率下降 均 值 为177 Hz,略 高 于 正 交 实 验 中 的 峰 值175Hz,且相对标准偏差(RSD)为1.5%,表明本文正交设计是有效可行的。
2.3 传感器的再生
用浓度为0.25mol/L的HCl洗脱20min,浓度为0.5mol/L的NaOH洗脱30min,实现DNA探针电极再生,可重复再生4次,超过4次则不适用检测。
2.4 固定化时间
在石 英 金 电 极 表 面 滴 加 活 化MWCNTs-COOH,测定频率下降值,发现30min后频率稳定.62min后频率波动较大,这表明30min后活化的MWCNTs-COOH在电极上吸附饱和,频降值达到峰值,62min后出现不稳定吸附,因此,选用30min作为MWCNTs-COOH固定时间;同理,DNA探针在金电极表面达到稳定饱和吸附时间为1h,杂交检测达到稳定饱和吸附时间为68min。
2.5 传感器的主要响应特性
在正交实验优化条件下,测定不同浓度待测物频率下降值ΔF,绘制ΔF-c曲线(见图2)。结果表明,在0.02~7.5μg/mL呈现线性关系,回归方程为y=27.617x+32.523,相关系数为0.996 4。在过低浓度下,杂交反应受非特性结合的影响较大,会偏离直线;在高浓度下,可结合的位点趋于饱和,也会偏离直线。
2.6 比较实验
为确定MWCNTs-COOH对DNA探针在电极上有效固定的作用,在正交优化的实验条件下构建电极,检 测5μg/mL肺 癌 特 征DNA,比 较 有 无MWCNTs-COOH情况下对检测灵敏度的影响,结果如图3所示。未修饰MWCNTs-COOH的传感器的响应峰值为73 Hz,而修饰MWCNTs-COOH的传感器的响应峰值为177Hz。实验结果表明,碳纳米管可增敏肺癌特征DNA检测。
2.7 样品分析 用研制 的 压 电 生 物 传 感 和 聚 合 酶 链 式 反 应(PCR)法对12例801-D人巨细胞性肺癌细胞样本进行检测,重复4次,结果如表3所示。由表可知,两种检测结果基本一致。阴性和阳性频降峰值呈显著差异,当ΔF1/ΔF0≥3.3(其中△F1为阳性样品所引起的频率变化,ΔF0为阴性样品所引起的频率变化)时,可判断该样品为阳性。
3 结束语
本文基于碳纳米管的表面积放大效应和生物相容性,构建了半胱胺-羧基化碳纳米管生物压电传感器,用于肺癌特征DNA的检测,与未加碳纳米管的传感器比较,检测灵敏度更高,可用于实际样品检测,并与PCR法无显著差异,具有临床应用价值。
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本文作者:谯康全 吴永强 刘新露




