免疫组织化学应用中，CSA可检测的敏感性大大增强，第一抗体的稀度可增大到1：1000000，在多数情况下稀释度可增加5～50倍，使非特异性背景信号降低。
别外，CSA法提供的强信号放大作用可克服组织细胞内相对高的自发荧光。CSA法可用于IHC的冰冻切片、石蜡切片和细胞涂片。别外，一个非常独特的应用就是同源性一抗的双重标记，因为与荧光标记二抗相比，CSA的阈值显著降低（敏感性高）。同种宿主动物的标记二种不同目标的第一抗体（如小鼠来源的单克隆抗体）用CSA技术可以检测，而不会出现明显的信号交叉。
首先第一种标记一抗用CSA法，使一抗的稀释度降低至不能被荧光标记二抗检测的程度。第二种一抗检测用常规荧光标记抗鼠二抗。可以连续使用二种方法，不同的荧光染料检测二种不同抗原的同属一抗。
